למרות כל ההערכות המוקדמות, גם המונדיאל ב-2006 לא ייערך באפריקה. בהצבעה שנערכה בצהריים בציריך נקבעה כי גרמניה תארח את אליפות העולם בכדורגל בעוד 6 שנים.
ההחלטה נפלה על חודו של קול, כאשר 12 מצירי ועידת פיפ"א הצביעו בעד הגרמנים ורק 11 רצו שהמונדיאל יגיע לאפריקה.
בסיבוב הראשון של הצבעה הושג שיוויון 11 בין שתי המדינות, כששתי המועמדות הנוספות, אנגליה ומרוקו, מסירות את מועמדותן.
ההחלטה התקבלה בניגוד לדעתו של מזכ"ל פיפ"א, ספ בלאטר, שתמך במועמדותה של הנציגה האפריקאית.
מה שהכריע את ההצבעה היה כנראה נסיונה העצום של גרמניה בארגון אירועים גדולים, בין היתר המונדיאל ב-74' ואליפות אירופה ב-90'. הגרמנים חייבים את הזכייה באירוח ל"קייזר", פרנץ בקנבאואר, שפעל רבות מאחורי הקלעים בשעות שלפני ההצבעה כדי להביא את המונדיאל לגרמניה למרות כל ההערכות המוקדמות.
לבקנבאואר יש כבר שני גביעי עולם בארונו - האחד כקפטן נבחרת גרמניה ב-74', והשני כמאמן הנבחרת הלאומית ב-90'.
משחק הפתיחה ייערך ככל הנראה באיצטדיון האולימפי במינכן והגמר בברלין.