בשנת 1986 מונה בן-עמי ליו"ר המועצה לתכנון חברתי במשרד ראש הממשלה. בשנים 1987-1991 כיהן כשגריר ישראל בספרד. בתפקידו פיתח קשרים טובים עם השלטון הספרדי, וליווה את כינון ועידת מדריד, בה התקיימו שיחות רב-צדדיות בין ישראל למדינות ערב.