דקארט טען כי בחר לשהות בהולנד נוכח נטייתו הליברלית היחסית של המשטר ההולנדי.
בהולנד בחר להקים ביתו באיזור מבודד ולהתמסר לעיוניו.
ב-1635 נולדה בתו מחוץ לנישואין של דקארט - פראנסין.
ב-1640, נפטרה הבת.
באוקטובר 1649 נעתר דקארט לבקשתה של המלכה כריסטינה משבדיה, ועבר להתגורר בשטוקהולם על מנת להיות לה מורה פרטי לפילוסופיה.
המלכה היתה דורשת מדקארט להגיע לחדרה בשעה 5 כל בוקר ולדון עמה בסוגיות פילוסופיות.
ב-2 בפברואר 1650, נפטר דקארט מדלקת ריאות.