
פרודון נולד לפחח עני בבזנסון, צרפת. ההוויה הקרתנית שאפיינה את שנות חייו הראשונות, השפיעה על הגותו, ופרודון אימץ לעצמו מעין סוציאליזם אגררי.
משבגר זכה למילגה במכללת בזנסון שם התמקד בלימודי שפות ומתמטיקה. אלא שמצבו הכלכלי לא איפשר המשך לימודיו, והוא נאלץ לעזוב את המכללה.
במסגרת עבודתו בבית דפוס, פגש את בן-עירו, הסוציאליסט פוריה.
ב-1838 עבר להתגורר בפאריז.
ב-1840 פירסם את ספרו הראשון: "הקניין מהו?" (Qu'est-ce que la propriété?). הספר עורר סערת רוחות נוכח הקו הרדיקלי-אנרכיסטי שאיפיין אותו.
ב-1842 כתב את ספרו השני: "Avertissement aux propriétaires", בעקבותיו הועמד למשפט, אך יצא זכאי.
פרודון עזב את פאריז לטובת ליאון ב1843. בליאון התחבר עם אגודת המוטואליסטים (mutualists).
בספרו: "שיטת הסתירות הכלכליות או הפילוסופיה של הדלות"
("Systegrave;me des contradictions économiques, ou Philosophie de la misegravere) שיצא ב15 באוקטובר 1846, תקף פרודון את מדיניותו הריכוזית של מארכס . מארכס מצידו, תקף את פרודון שנה לאחר מכן בספרו: "דלות הפילוסופיה" (La misegrave re de la philosophie ).
באוקטובר ,1847 ערב מהפכות 1848 (אביב העמים) חזר פרודון לפאריז והחל בעריכת כתבי-עט אנרכיסטים. הוא נתמנה לבית הנבחרים המהפכני וניסה להקים בנק בלתי-רווחי.
ב1849 יצא ספרו: "וידויו של מהפכן" (Confessions d'un revolutionairre).
בתקופת נפוליאון השלישי נכלא ובין השנים 1849-1852 שהה בבית הסוהר. בעת מאסרו נישא, וב-1850 נולדה בתו.
ב-1858 נאלץ לעזוב את צרפת לטובת בלגיה לאחר פירסום ספרו: "על הצדק במהפכה ובכנסיה" ("De la justice dans la Revolution et dans l'eglise").
ב1863 הורשה לחזור לפאריז, שם נפטר כעבור שנתיים.