בשנת 1967, ערב מלחמת ששת הימים, הצטרף לממשלת אחדות בראשות לוי אשכול ומונה לשר בלי תיק. צעד זה היווה פיוס היסטורי בין מפלגת העבודה לתנועת החרות. בגין פרש מהממשלה ב-1970 לאחר שלא הסכים להכיר בהחלטת האו"ם 242 שקראה לנסיגת כוחות צה"ל מהגדה ומרצועת עזה.
בשנת 1973 הקים בגין את מפלגת הליכוד כקואליציה בין מספר מפלגות, ביניהן גח"ל ומספר מפלגות ימין-ליברלי קטנות.
בשנים 1974-1977 כיהן כחבר בוועדת חוץ וביטחון.