לאחר הקמת צה"ל מונה לאלוף ולמפקד פיקוד הדרום. במלחמת העצמאות פיקד על הלחימה לשחרור הגליל העליון, צפת, פרוזדור ירושלים, השפלה הדרומית, הנגב, באר שבע ואילת. בנושף פיקד על הכוחות בסיני אך נאלץ לסגת בפקודת בן גוריון.
בשנת 1949 השתחרר מצה"ל בדרגת אלוף ופנה לחיים ציבוריים.