העיתונות האירופית הטילה ספק בגירסה הרשמית לפיה נרצח קנדי על-ידי אוסוולד, בשל תמיכתו של אוסוולד בקובה המארכסיסטית. תיאוריות קונספירציה שונות הועלו ברחבי העולם.
ב- 29 בנובמבר מינה יורשו של קנדי, ג'ונסון, ועדה בראשות נשיא בית המשפט העליון, ארל וורן, לחקור את נסיבות הרצח.
לאחר 9 חודשי חקירה, מסרה הועדה דו"ח מקיף, אשר ממצאיו פורסמו מיד עם הגשתו. הדו"ח אישש את הגרסה הרשמית, לפיה נרצח קנדי על-ידי אוסוולד, וזה האחרון פעל באופן עצמאי, ולא כחלק מקנוניה כלשהי. בנוסף, טענה ועדת וורן כי לא מצאה כל בסיס להניח שרוצחו של אוסוולד, ג'ק רובי, נשלח על-ידי גוף כלשהו, ונטען כי גם הוא, פעל באופן עצמאי.
בשנת 1966 פירסם סטודנט צעיר למשפטים בשם ג'יי אפשטיין את עבודת הדוקטורט שלו, אשר בדקה את אמינותו של דו"ח ועדת וורן. הספר הביא ראיות ברורות לכך שקנדי נורה על-ידי שני מתנקשים, והניח בסיס נרחב לאמונה כי מאחורי ההתנקשות עמד קשר שטרם נתגלה.
הספר, אשר היה הראשון בשרשרת ספרים דומים, עורר סערת רוחות בארה"ב.
עד עצם ימינו אנו מתפרסמים מחקרים שונים בנושא רצח קנדי, ורבים נוטים להאמין כי אוסוולד לא היה אלא כלי שרת בידי בעל עניין כלשהו אשר רצה במותו של הנשיא.