
בשנת 1797 יוצא למלחמה במזרח התיכון בתקווה לכבוש את האזור.
הוא כובש את מצרים אך מובס בקרב הנילוס על ידי אדמירל נלסון הבריטי. צבאו נלכד למצרים ונכשל בנסיון להתקדם לסוריה. הוא נבלם מול חופי עכו ונסוג חזרה למצרים.
נפוליאון חוזר לצרפת עקב שמועות על מצבה הרעוע של הממשלה. הוא נוטל את השלטון לידיו ומקים ממשל חדש בראשות שלושה קונסולים וכשהוא אחד מהם. כך הפך לשליטה של צרפת.