עמוס קינן נשוי פרופ' נורית גרץ, חוקרת ספרות וקולנוע. הם חיים ביחד מאז 1962 אך נישאו כדת משה וישראל רק כעבור כ - 30 שנה. יש להם שתי בנות, שלומציון(1969) ורונה (1979).