באוקטובר 1991 הכריז קלינטון כי הוא מתכוון להתמודד על ייצוג המפלגה הדמוקרטית במירוץ לנשיאות. התמודדותו אוימה בעקבות פירסום שערוריות מין שונות שהיה קשור אליהן לכאורה, והאשמות על שהשתמט משירות בויאטנם. לאחר פריימריס ארוכים הוא גובר על המתמודדים האחרים, ביניהם ג'רי בראון ופול צונגה, ונבחר לנציג המפלגה הדמוקרטית לנשיאות. הוא בוחר בסנטור אל גור מטנסי להיות סגנו. את רוב מסע הבחירות העבירו באוטובוס שנסע לאורכה ורוחבה של ארה"ב, בפגישות עם אזרחים והדגשת נושאי בריאות ורווחה.
ב-3 בנובמבר 1992 מנצח את המועמד הרפובליקני, הנשיא המכהן ג'ורג' בוש, ונבחר לנשיא ה-42 של ארה"ב.