פרנציסקו דה באמונדה פרנקו נולד באל פרול (El Ferrol), ספרד.
הוא היה השני מבין ארבעת ילדיו של קצין בחיל הים הספרדי, מן המעמד הבינוני הגבוה.
עקב היעדרויותיו התכופות של האב, התחנך פרנקו בעיקר על-ידי אמו, קתולית אדוקה, נצר למשפחת אנוסים.
פרנקו יועד גם הוא להיות ימאי, אולם נסיבות התקופה אילצו אותו להתפשר, והוא הצטרף, ב- 1907, לאקדמיה הצבאית בטולדו.
את לימודיו באקדמיה סיים ב- 1910, ושנתיים לאחר מכן הוצב בצפון מרוקו, איזור שהיה תחת ריבונות ספרדתית, ונתון היה לתסיסה לאומית תכופה.
במהלך שנותיו הראשונות במרוקו הוכיח כישרון צבאי גבוה והתקדמותו בשורות הצבא היתה מהירה. בשנת 1915 הפך למפקד הצעיר ביותר בתולדות ספרד.
ב- 1916 נפצע מיריה ונשלח להחלים בספרד.
משהחלים, הוצב כמפקד גדוד בצפון ספרד. אולם פרנקו שאף לחזור לחזית המרוקאית ולקראת סוף 1920 עזב את אירופה וחזר למרוקו, שם מונה, ב- 1923 למפקד לגיון הזרים הספרדי.
באותה שנה נישא לכרמן פולו, אותה פגש במהלך שהותו בצפון ספרד.