עם הירצחו של ג'ון, הופנו הזרקורים לג'קי בעוצמה יתרה, ועל אף שביקשה לפרוש מן הבמה הציבורית, הפכה האלמנה הצעירה למוקד לרכילות ושמועות.
היא עברה להתגורר בניו יורק שם פגשה את הכלכלן היווני המצליח, אריסטו אונאסיס (Aristotle Onassis), המבוגר ממנה בכ- 23 שנים.
ב- 1968 נישאו השניים וז'קלין פרשה מן העין הציבורית לטובת חיי מותרות על אי בבעלותו הפרטית של אונאסיס.
עם מותו של אונאסיס בשנת 1975, חזרה ז'קלין לארה"ב והתיישבה בניו יורק.