בחודש אפריל 1984 חוליית מחבלים חטפה אוטובוס של אגד קו 300 אשר היה מלא בנוסעים.
צהל השתלט על האוטובוס ולכד שני מחבלים אשר נותרו בחיים לאחר ההשתלטות,יצחק מרדכי אשר היה קחצר באותה העת חקר את שני המחבלים והעבירם לידי השבכ.
השניים מתו במהלך חקירת השבכ אשר טענו להגנתם כי מרדכי היה זה אשר המית את המחבלים.
במסגרת פרשה זו השתמש זמיר בסמכותו והורה למשטרה לחקור חשדות פליליים כנגד אנשי השבכ המעורבים בפרשה.
זמיר כיועמש הצליח לעמוד בפרץ ודחה לחצים של ראש הממשלה דאז שמעון פרס,יצחק שמיר אשר החליף את פרס בראשות הממשלה במסגרת ממשלת האחדות ויצחק רבין להשתיק את הפרשה.
עקב פרשה זו הודח יצחק זמיר מתפקידו כיועץ משפטי לממשלה.