ב- 1660 עזב שפינוזה את אמסטרדם לטובת ריינסבורג (Rijnsburg) השקטה, שם החל מתבודד, מסתגר עם הגותו.
נראה שבריינסבורג התרחש החלק הארי של פעילותו הפילוסופית; ב- 1662 סיים את "מאמר קצר על אלוהים, האדם ואושרו" ("Korte Verhandling van God, de Mensch en Deszelfs Welfstan"), את "מאמר על תיקון השכל" ("Tractatus de Intellectus Emendatione"), ואף השלים את תגובתו ל"הגיונות" הקרטזיינים.
תגובה זו אשר ראתה אור ב- 1663 תחת השם "עקרונות הפילוסופיה" ("Principia Philosophiae"), היתה לספר היחיד שפורסם תחת שמו של שפינוזה במהלך חייו.
בנוסף, מביתו בריינבורג, נוהג היה להתכתב עם ידידיו, חסידיו ומבקריו. מכתבים אלו נתפרסמו לאחר מותו ("איגרות" לברר שנה) ונושאים ביאורים חשובים של סוגיות מרכזיות במשנתו.
ביוני 1663 עזב את ריינסבורג ועבר לשהות בוורברג (Voorburg), בקרבת האג.