בשנים 1964-1968 למד קלינטון באוניברסיטת ג'ורג'טאון בוושינגטון יחסים בינלאומיים. בסיום לימודיו זכה במלגת לימודים יוקרתית ללימודים באוניברסיטת אוקספורד בבריטניה.
ב-1970 שב לארה"ב ולמד משפטים באוניברסיטת ייל. הוא סיים את לימודים ב-1973.
בזמן לימודיו בייל עבד במטה הבחירות של המועמד הדמוקרטי לנשיאות, ג'ורג' מקגוורן. מקגוורן הובס בסופו של דבר על ידי רוצ'רד ניקסון.