עם פרוץ מלחמת העולם השניה בספטמבר 1939 וכניסתה של בריטניה למלחמה נגד האויב הנאצי הפסיק האצ"ל את מאבקו בבריטים והודיע על נכונותו לסייע במאבק.
על רקע הפסקת המאבק חל פילוג באצ"ל ופרש ממנו פלג קיצוני בראשותו של אברהם (יאיר) שטרן אשר הקים את ארגון הלח"י.
בשנת 1941 באחת ממבצעי האצ"ל בשיתוף עם הבריטים נפל מפקד האצ"ל דוד רזיאל, והפיקוד הועבר לידי יעקב מרידור אשר נשא בתפקיד עד שנת 1943. בסוף שנת 1943 עבר הפיקוד לידיו של מנחם בגין ובפברואר 1944 פירסם האצ"ל את "הכרזת המרד" אשר קבעה כי אין עוד שביתת נשק בין האצ"ל לבין הבריטים והחל בפעילות נגד הבריטים ונגד מרכזי שלטון בריטים בארץ.ראשי הנהגת הישוב התנגדו בחריפות לפעולות אלו ודרשו להפסיקן ולקבל את מרות ההנהגה המרכזית.