באוקטובר 1967 רק 3 חודשים לאחר אסון "פורסטר" יצא מקיין להפצצה ה-23 במספר על אדמת צפון וייטנאם.
המטרה הייתה תחנת כח במרכז בהאנוי,כאשר מקיין השלים את משימתו נפגע מטוסו על ידי טיל קרקע אוויר ומקיין נאלץ לנטוש.
מקיין נשבה על ידי המון וייטנאמי עם הגעתו לקרקע,ולאחר ששברו את ידיו ורגליו נשלח ל-"הילטון האנוי",כלא וייטנאמי ידוע לשמצה אשר בו שהו שבויי המלחמה האמריקאים.
מקיין אשר הינו בנו ונכדו של אדמירל בצי האמריקאי הפך להיות שבוי "מיוחס" והוייטנאמים הציעו את שחרורו המוקדם בתקווה לזכות באהדה.
אמון לקודים של שבויי מלחמה סירב מקיין להשתחרר שכן על פי קודים אלו מי שנשבה ראשון הוא גם זה אשר משתחרר ראשון.
מקיין שהה יותר מחמש שנים בשבי מהם שנתיים בבידוד.