כשפרצה מלחמת העולם השניה התנה גנדי את תמיכתה של הודו בבריטניה בקבלת עצמאות מלאה להודו.בשנת 1944 הסכימה בריטניה למתן עצמאות מלאה בתנאי ששני הפלגים בהודו ,הליגה המוסלמית ומפלגת הקונגרס ילבנו את חילקי הדעות ביניהן.
גנדי התעקש על מתן עצמאות להודו אחת ללא התפלגות אולם נאלץ לסגת בתקווה שהענות לדרישת ההפרדה של המוסלמים תביא לשלום המיוחל.
בריטניה נתנה עצמאות מלאה להודו בשנת 1947 והודו ופקיסטן הפכו למדינות נפרדות עם מתן העצמאות.
הפירוד הוביל למהומות ענק בין מוסלמים להינדים,מהומות אשר גנדי ניסה למנוע בכל כוחו ואף היה צם למען השלום בין שתי הדתות.