בינואר 1933 עבר שלטון גרמניה לידי הנאצים, ופלוגות הסער, אשר מנו עתה מעל שני מיליון חיילים, הפכו למטרד; רהאם דרש הכפפת הצבא כולו לס"א, אולם מנהיגי הצבא סלדו מן העבריינים המאיישים את הפלוגות.
במקביל, החל רהאם מתקרב לאגף "השמאלני" של המפלגה, אשר דרש קביעת רפורמות חברתיות, והימנעת מהתחברות פוליטית למפלגות הימין המסורתיות שבסיס כוחן במעמד הגבוה.
בתחילת 1934 גברה המתיחות בין רהאם למפקדי הגסטאפו והס"ס, גרינג והיינריך הימלר (Himler). וכאשר נדרש היטלר לבחור לו צד בעניין, צידד בגרינג והימלר כנגד רהאם והס"א, אשר משעבר השלטון לידי הנאצים, לא היה בם עוד צורך.
ביוני 1934 החל היטלר טוען כי רהאם קושר נגדו ומאיים לקחת שלטון גרמניה לידיו.
ב- 30 ביוני 1934 נעצר רהאם במינכן באשמת בגידה וקשירת קשר מהפכני. הוא הושם בכלא שטאדלהיים בעיר, וכעבור שעות ספורות הוצא להורג.
היה זה סופו של הס"א; באותו הלילה, אשר נודע כ: "ליל הסכינים הארוכות", חוסלה צמרת הס"א כולה.