מנחם גולן נשוי מאז 1951 לרחל, מטפלת בשיטת פלדנקרייז. יש להם שלוש בנות: רותי, פסיכולוגית קלינית שמתמחה בחקר השואה, נעמי, פעילה בארגונים למען בעלי חיים ויעל, מפיקת סרטים.