בדצמבר 1969 מונה פרס לשר לקליטת עלייה, תפקיד אותו מילא עד יולי 1970, ומספטמבר 1970 עד אפריל 1973 כיהן כשר התחבורה ושר התקשורת, בממשלת גולדה מאיר.
ממרץ ועד יוני 1974 כיהן כשר ההסברה בממשלת מאיר.
ביוני 1974 מונה לשר הביטחון בממשלת רבין, וכיהן בתפקיד זה עד יוני 1977. בתפקידו זה הורה ב-1976 על המבצע לחילוץ חטופי מטוס "איר פראנס" באנטבה.