ב-1989, בזמן כהונתו כשר המדע והטכנולוגיה בממשלת האחדות, נפגש עם נציגי אש"ף, דבר שאסור היה על פי חוק. בעקבות המפגשים איים ראש הממשלה שמיר לסלקו מהממשלה. לאחר פירוק הממשלה החליט שוב לעזוב את הפוליטיקה, והתפטר מהכנסת בפברואר 1992.