באוגוסט 1999 מונה דהן לסגן שר האוצר. ביולי 2000, כאשר ש"ס פרשה מהקואליציה של ברק, פרש מהתפקיד. עם כינון ממשלת שרון במרץ 2001, מונה לשר הדתות.