לפני בחירות 1999 הצטרפה רבין-פילוסוף למפלגת המרכז ונבחרה מטעמה לכנסת.
לאחר הקמת ממשלת שרון במרץ 2001 פרשה רבין-פילוסוף מהמפלגה והקימה סיעת יחיד בשם "דרך חדשה".
בממשלת שרון מונתה לסגנית שר הביטחון.
היא כיהנה כיו"ר ועדת האתיקה, וכחברה בוועדת חוקה, חוק ומשפט, הוועדה לקידום מעמד האשה, הוועדה לעניני ביקורת המדינה והוועדה לקידום מעמד הילד.