בהתייעצות ביטחונית שנערכה הערב, בנוכחות שר הביטחון, שאול מופז, והרמטכ"ל, רב אלוף משה יעלון, אושרה שורת פעולות מבצעיות מיידיות בתגובה לתקרית בציר פילדלפי. בגלי צה"ל דווח כי גורם ביטחוני אמר כי "צה"ל יתבע את המחיר מהגורמים האחראים לאירוע הקשה".
מערכת הביטחון אישרה תגובה לתקרית בציר פילדלפי