ביוני 1956 מונתה מאיר לשרת החוץ. בתפקידה פעלה רבות לפיתוח קשרי החוץ של ישראל, בעיקר עם המדינות המתפתחות באפריקה. היא כיהנה בתפקיד עד 1965, השנה בה פרשה מהממשלה. בשנים 1966-1968 כיהנה כמזכירת מפא"י. בתפקידה זה היתה מיוזמי הקמתה של מפלגת העבודה.