לאחר מאבק משפטי על תוצאות הבחירות, מונה ג'ורג' בוש הבן לנשיא ארה"ב בינואר 2001. צ'ייני נכנס לתפקידו כסגן הנשיא ונחשב לאחד מסגני הנשיאים רבי ההשפעה והעוצמה בתולדות הממשל האמריקאי, הודות לנסיונו הפוליטי העשיר.